@cege Aangezien je in vorige posts daar wel wat over leek te kunnen zeggen: hoe scalable is PACB's SBB tech? Kan daar redelijk straightforward NovaSeq throughout instrumenten voor gemaakt worden? Waarom starten bij een medium-throughput klasse instrument?
SBB lijkt me 95% identiek aan de SBS van illumina. "Gewoon" een slimmigheidje bij de optical uitlezing. Eens je de nucleotides, fluo dies en polymerases hebt (kost veel in ontwikkeling en IP minefield..), is dat relatief schete goedkoop om te manufacturen.
Dus mid to high throughput is allemaal mogelijk.
Nextseq like throughput is ook al meer dan genoeg voor 90% van de labos en use cases. Novaseq is echt volume draaien met giga upfront capex voor grote labos. Lijkt me verstandig om je technology eerst wat te matureren voor je die markt op duikt.
Je vermelde ook dat HiSeqs tot op de draad versleten worden, die zijn dit jaar/volgend jaar allemaal end of life dus zit er daar wel een vervang-golf aan te komen. Raar dan dat PACB niet eerst inzet op dat type instrumenten? Die golf dreigen ze dan te missen.
Sequencing is capex intensive en workflow intensive. Een nextseq kost roughly 100k. Een flowcell 1-2k. De listing prices zijn beetje fake, veel klanten hebben specifieke deals met veel of weinig capex en fan weinig of veel opex; renting deals; leasing deals etc.
Een machine die in routine loopt doet gemakkelijk 50 tot 100 runs per jaar. Een hiseq tot op de draad verslijten, zal uiteindelijk 95% van de keren door een novaseq/nextseq vervangen worden. Maar die opex is grotendeels hetzelfde (Illumina heeft een inruilprogramma). En je workflow moet altijd beetje gefinetuned worden per machine. Switchen doe je enkel als het moet dus.
Pacbio zit daar goed met de ONSO.
Ik zit wat met twijfel rond allocatie tussen PACB (veelbelovend)/ILMN (die maar.blijft dalen intussen op 5y-low of zoiets maar dus.nog.goeie kaarten in handen heeft).
De sequencing business ligt volledig op zijn gat door meerdere redenen. Die zal wel terug versnellen. Wie welk deel van de koek pakt, zal afhangen van de market dynamics. Naast pacbio en illumina is er nog MGI/BGI die hard pusht.
Er is ook Element met zijn Aviti. Daar heb ik zelf data van gezien en daar is niks op aan te merken. Ziet er goed uit, goeie workflow. Maar rumor has it dat thermo die gaat kopen (Element is private, no free money here). De vraag is altijd hoe de commercialisation efficient kan doorgeduwd worden. Sequencing is capex en workflow intensive. Switching cost is hoog. Al die providers weten dat en hebben goeie strategien om je vast te houden.
BGI is cheap maar beetje omslachtig (zoals Illumina in het begin was)
Illumina is relatief cheap en standard of practice
PacBio is beetje duurder en trager maar heeft hogere accuracy, long en short read. Ik denk dat veel non-sequencing labos naar Pacbio kunnen stappen als eerste machine. Labos met specifieke use cases (e.g. liquid biopsies die hogere accuracy nodig hebben; RNA zaken waar je lange reads nodig hebt, ...) kunnen naast illumina pacbio hebben of switching
Element, I don't know. Lijkt me een private ding dat enkel er op uit is om gekocht te worden
Sequencing business is niet iets zoals een nieuwe auto kopen waar je vorige keer een Peugeot hebt en nu een Fiat. Je upfront lab flow en je downstream data processing zijn ook kostelijk. En die zijn grotendeels specifiek voor je machine. Ik denk niet dat Illumina van de ene dag op de andere een krimpende install base gaat hebben. Wel kan er op langere termijn market share verlies zijn als de nieuwe klanten niet meer 90-95% naar Illumina gaan. En vooral price/margin pressure - alhoewel dat nog zou moeten meevallen. Wij zien zelf enkel in de 'apenlanden' veel requests voor BGI omdat het goedkoper is (typisch Z Amerika, Italie, Spanje, Z Azie). Naar mijn gevoel wederom klanten waarvoor sequencing momenteel te duur is en die enkel zullen overstappen van arrays of andere legacy methodes als er een 'inferieure' provider is met cheap solutions. Niet echt een bedreiging voor Illumina.
But that being said. Geen idee hoe de markt er kwantitatief zal uitzien binnen 2-3y.
