Stukken verdwenen
Het onderzoek van het federaal parket ging intussen voort met huiszoekingen in andere bisdommen, ook toen onderzoeksrechter De Troy in maart 2012 opstapte en vervangen werd door onderzoeksrechter Colette Calewaert. In oktober 2012 raakte echter bekend dat er 445 stukken uit het dossier verdwenen waren, in de periode dat onderzoeksrechter De Troy vervangen werd. Een aantal zouden per vergissing door de poetsvrouw zijn weggegooid, maar een deel zou ook door de toenmalige griffier van De Troy zijn meegenomen naar huis, zonder dat ze ooit terug op kantoor geraakten. Onderzoeksrechter Calewaert stelde proces-verbaal op van die verdwijning en nadat een reeks kopieën waren gemaakt, werd ervan uitgegaan dat het dossier weer volledig was, waarna de Brusselse KI in februari 2013 oordeelde dat het onderzoek voortgezet kon worden.
Dat arrest werd echter verbroken door het Hof van Cassatie maar toen een nieuwe KI zich in januari 2014 over de netelige kwestie boog, bleek dat er meer pv's verdwenen waren dan de 445 waarvan eerst sprake. Ook daarvan werden kopieën aan het dossier toegevoegd, waarna de KI op 29 oktober 2014 uiteindelijk oordeelde dat het onderzoek kon voortgaan.
Een maand eerder, in september 2014 had onderzoeksrechter Calewaert haar onderzoek al afgesloten. Anderhalf jaar later heeft het federaal parket nu zijn eindvordering klaar. Daarin stelt het dat er niemand meer kan vervolgd worden door eerdere veroordelingen, overlijdens en verjaring. Het is nu aan de Brusselse raadkamer om zich daarover uit te spreken.