Mods zijn MODificaties (veranderingen, toevoegingen) aan een spel die door fans is gemaakt, zoals bijv een mod waardoor de vijanden niet meer verdwijnen, het geluid van je wapens anders klinkt, dat je pistool er anders uit ziet, enz... normaal gezien moet je die mods in je "base" map steken in je Doom3 directory en dan werkt oftewel de mod automatisch, of je moet hem activeren bij het main menu bij "mods"