Archief - op zoek naar een desktop pc met 'extreme' rekenkracht

hallo iedereen,

ik werk in de biotechnologie en op ons labo zijn we aan het denken om een nieuwe pc te kopen (budget is niet extreem doorslaggevend, rekenkracht wel), we hebben een pc nodig die goed is in het vergelijken en analyseren van data (dus niet grafisch maar pure rekenkracht). welk systeem denken jullie dat aan te raden is? M'n bazen hebben hun ogen laten vallen op een mac (prob g5 or better), maar nu zat ik te denken of die niet beter zijn in grafische applicaties dan rekenkracht? Iemand tips? alvast bedankt.

Is die software van jullie wel compatibel met mac ?
Hmm, pure rekenkracht, dan kopen jullie beter van die clusterpc's of hoe da ook noemt ? In zo'n mountain racks ?

*edit*
Hmm, moet desktop pc zijn.
Neem dan zo'n dual cpu bordje. Iet met een Amd Athlon FX erin ofzo .

@Psychodweep: Mounting racks bedoel je? Geen bergen he

OT: Is die software multi-threaded (= kan hij gebruik maken van meerdere cpu's, of benut hij maar een?)? Indien ja: Dual Opteron, AMD X2 of Dual G5 (Mac) zal de oplossing vermoedelijk zijn.
Ik denk dat er niet veel mensen zijn hier op het forum die je daar mee zullen kunnen helpen, pm eens naar 'apa', die gaat daar waarschijnlijk wat meer van kennen.

cheers,

waar zou ik daar eventueel info over kunnen vinden, software gaat waarschijnlijk geen meerdere proc. ondersteunen.

de vraag is om voor mac of vb voor een goeie amd 64 of fx te gaan.

Wanneer je een mac gaat kopen gaat kopen ga je veel betalen voor die Dual G5, maar die andere componenten gaan jullie ws nooit echt nodig hebben

Daarom zou ik het bij pc houden, zoals ze hierboven al zeiden.

Om een echt duidelijk advies te geven zou ik veel beter moeten weten wat voor berekeningen je precies wil uitvoeren... Afhankelijk van het soort werk zal je al dan niet veel geheugenbandbreedte, veel RAM, ... kunnen gebruiken. Ik zal hierna wat algemene bemerkingen geven.

x86-systemen (Intel en AMD) zijn vooral sterk voor wat betreft berekeningen met gehele getallen (of reeksontwikkelingen met gehele getallen zoals Pi-berekeningen bijvoorbeeld). Als de gebruikte software niet multi-threaded is, dan kan je beter bij een single-CPU systeem blijven. Als de software kan werken met 64-bit eenheden, dan zou ik ook zeker een 64-bit CPU nemen. De beste keus lijkt mij dan ook een Athlon64 FX-57. Is je software multi-threaded, dan zou ik voor een dual-Opteron moederbord gaan met 2 Opteron 275 (dual-core) gaan (eventueel begin je met 2 single-core Opteron's die je later eventueel kan upgraden). De Pentium4 en Xeon vind ik voorlopig niet interessant (zeker niet voor het soort werk dat jij wil uitvoeren).

De PowerPC in de Mac's beschikt over zgn. "Altivec"-instructies. Dit zijn instructies die specifiek gericht zijn op vector-berekeningen. Dat is dan ook meteen de grootste kracht (op hardware-vlak) van de Mac. De performance in integer en floating-point berekeningen is véél lager dan bij x86-processoren. Als je berekeningsoftware niet specifiek gebruik kan maken van die Altivec-instructies, dan zou ik niet te veel aandacht besteden aan de PowerPC.

Zijn je eisen nog veel groter dan dat qua performance, dan kan je misschien eens een kijkje nemen naar Power-workstations van IBM (met IBM Power4+ processor) of PA-RISC / Alpha workstations van HP. Die zijn wel een stuk duurder dan x86 of G5 systemen, maar zijn ook veel krachtiger wat betreft floating-poinrt berekeningen. In integer-berekenigen zijn die dan weer weinig indrukwekkend. Itanium kan ik voorlopig niet aanraden omdat je die vrijwel nergens terugvindt in workstations en dat de meeste fabrikanten die na een korte tijd weer van de markt halen omdat die niet blijken te verkopen... Da's niet zo interessant als je een minimum aan support wil hebben.

Heel mooie uitleg apa, maar waar is Jacques Villeneuve gebleven ?

thx for the tips

Post eens wat type bewerkingen: integer, floating point ? Is SSE2 of SSE3 ondersteund in dat programma ? Zijn de berekeningen opdeelbaar in losse stukken (distributed computing), ...

kga u morgen meer info kunnen geven en zal u dan pm'en

cheers

de software is gebouwd met java en de huidige versies zijn nog niett getest of gebouwd voor multithreading (genespring from agilent)